Donde estan mis aplicaciones??

Hola a todos, tengo el ipad2 con el jailbreak echo y tenia ya bastantes aplicaciones intaladas... El caso es que ayer tube que conectar el ipad al pc por el usb para pasarme unas cosillas y empezo a sincronizarse automaticamente como siempre, y ahora mismo me acabo de dar cuenta de que todas las aplicaciones que tenia han desaparecido. A sido a causa de haberlo pinchado al pc?? Si es asi... Que hago en un futuro cuando necesite pasarme algo al ipad??

Muchas gracias...

Eso es muy raro lo que pasa es que si se sincronizo es que lo tienes que tener el iTunes donde pone aplicaciones y si tienes hecha copia de seguridad no tendrías ningún problema ya que solo tendrías que restaurarlo desde la copia de seguridad.