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Hola,
el iPad es muy especial en cuanto a los archivos que permite guardar. Ello requiere aplicaciones específicas para cada tipo de archivo.
En el caso de mencionas, como de PDF, podrías usar el iBooks y guardar tus archivos a través de iTunes, pero esto es muy complicado.
Recomiendo altamente crear una red domestica para compartir archivos, lo cual implica una transferencia de archivos más rápida.
Muchas aplicaciones incluyen esta opción. Como ejemplo, está la aplicación Documents: https://itunes.apple.com/mx/app/documents-5-lector-rapido/id364901807?mt=8 que permite leer documentos.
Dependiendo del tipo de archivo, será la aplicación que usarás. Claro que hay algunas, como la que menciono arriba que es muy versátil y abre muchos formatos, aparte de documentos están imágenes, videos, etc.
Saludos.